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Mouhssine El Badaoui est né à Casablanca au sein d’une famille d’artistes de la scène. Son père est l’un des fondateurs du théâtre professionnel au Maroc. Mouhssine a d’abord travaillé comme technicien au sein de la troupe de théâtre El Badaoui, puis comme comédien et metteur en scène. Il a participé à plusieurs tournées dans le royaume et a mis en scène et réalisé des séries radio, séries télévisées et pièces de théâtres.

Il étudie ensuite la réalisation en Belgique à l’IAD (Institut des Arts de Diffusion), où il obtient son master en 2002. Son film de fin d’études et premier documentaire, Brûleurs de frontières, qui traite sur un ton doux-amer de l’émigration clandestine, participera à plusieurs festivals et sera diffusé sur Canal Plus.

Mouhssine a également travaillé comme régisseur adjoint sur des téléfilms en Belgique, ensuite comme premier assistant réalisateur sur les films étrangers tournés dans le sud du Maroc comme Babel, 13 Hours, Billy Lynn’s long half time walk ou récemment John Wick Chapter 3 Parabellum.

Il rejoint la RTBF (Radio et Télévision belge) en 2007, où il réalise plusieurs émissions en multicaméra comme Au quotidien, Mise au point, 69 minutes sans chichis, On n’est pas des pigeons.